甘肃莲花山国家级自然保护区位于甘肃南部，与甘肃省东南部的康乐、临潭、卓尼、临洮、渭源5县接壤，坐落在甘肃省临潭县北部的八角乡境内，汇集的三角地带总面积125.51平方公里。是黄河一级支流-洮河的重要水源涵养区之一。保护区地处青藏高原向黄土高原过渡地带，在我国重要的候鸟迁徙通道上，是我国重要的生物多样性保护和研究基地，也是陇上有名的风景旅游区，世界非物质文化遗产—“莲花山花儿”的故乡，总面积11691公顷。

保护区内生物资源丰富，有野生种子植物95科367属911种，列入国家重点野生保护植物3种，列入国家重点保护野生动物41种，属自然生态系统类别森林生态类型自然保护区，主要保护对象为森林生态系统及其生物多样性。森林植被主要为山地寒温性针叶林，分布具有明显的垂直带谱。

1983年经甘肃省政府批准成立的正县级事业单位，隶属省林业厅领导。2003年6月，经国务院批准晋升为国家级自然保护区。2010年5月，经中国人与生物圈国家委员会批准，成为中国人与生物圈保护区网络成员单位。

2015年1月，被国家林业局确定为首批“全国林业信息化示范基地”建设单位。2016年10月，被中国动物学会鸟类分会授予“中国濒危雉类研究基地”荣誉称号，2018年12月，被中国林学会授予“第四批全国林业科普基地”称号。